新奥尔良大学化学教授史蒂夫·里克和计算机科学教授克里斯·萨马是一个全球研究联盟的成员，该联盟研究如何抑制导致COVID-19的病毒。

COVID-19高性能计算联盟是一项公私资助计划，由白宫科技政策办公室、美国能源部和IBM牵头，旨在将联邦政府、行业和学术领袖聚集在一起，加速对抗新型冠状病毒的研究。

Rick和Summa的研究是关于病毒蛋白解旋酶，这是一种有希望对抗导致COVID-19的严重急性呼吸综合征冠状病毒2 （SARS-CoV-2）的目标。

病毒需要解旋酶蛋白才能在体内复制和生长。如果研究人员能设计出一种附着在这种蛋白质上的药物，它就能抑制病毒的生长。然而，由于解旋酶高度灵活的性质，设计一种适合的药物是很困难的，因为你可能并不真正知道要针对的结构。Rick和Summa的研究旨在了解解旋酶蛋白是如何移动和改变结构的。

“从蛋白质的三维结构来看，抑制剂可以被设计成阻碍病毒的复制，但解旋酶的灵活性使其成为基于结构的药物设计的挑战，”里克说。“我们将在一些世界上最快的计算机上使用高性能计算，以更好地了解解旋酶的灵活性。”

美国国立大学的研究人员已经获准使用位于圣地亚哥超级计算中心的一台超级计算机，它被恰如其分地命名为“彗星”。

“我们正在运行解旋酶的动力学，这是一种相当大的蛋白质，所以我们可以跟踪它是如何运动的，”里克说。“模拟使我们能够看到所有原子是如何运动的。不管有没有潜在的药物，我们都可以做到这一点。”

这些计算机模拟将由新奥尔良大学开发的一种增强的抽样方法辅助，使研究人员能够更快地确定结构变化。所得到的结构将被聚集到不同的结构组中，并与科学界共享，这样它们就可以用于药物设计。

Summa说：“通过研究它是如何运动的，我们可以找出它最有可能的形状或构象，我们将与其他药物设计专家科学家分享。”